起诉离婚抚养权应作以下处理：1、由当事人双方进行协商；2、协商不成的，由法院根据最有利于孩子成长的原则进行判决。离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决等。
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根据双方抚养意愿，抚养能力，以最有利于孩子的原则判决
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若一方不愿意离婚，你要起诉离婚，那么你需要提供证据证明夫妻感情已经破裂。在诉状中写明对抚养权的要求即可。一般会对子女成长最有利的一方抚养子女