当你向劳动行政部门投诉老板扣工资时，根据《劳动法》第九十一条的规定，劳动行政部门会对此进行调查。如果确认用人单位确实存在克扣劳动者工资的情况，他们会责令用人单位支付你的工资报酬、经济补偿，并可能要求支付赔偿金。这是保护劳动者合法权益的重要法律途径，确保你的劳动所得不受侵害。
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从法律角度看，你作为劳动者享有工资报酬权、经济补偿权等权利。根据《劳动法》的相关规定，用人单位不得克扣或无故拖欠你的工资。若发生劳动争议，你有权申请调解、仲裁或提起诉讼，以维护自己的合法权益。
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如果你想先尝试协商，可以直接与老板沟通表达你的诉求。协商不成时，可申请调解，具体操作是：向本单位的劳动争议调解委员会提交调解申请，由调解委员会组织双方进行调解。若调解仍无果，再考虑申请仲裁或诉讼。