若公司扣押员工提成，员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。根据《劳动法》的相关规定，用人单位有义务按照约定向劳动者支付工资，扣押提成属违法行为。员工投诉或仲裁成功后，公司不仅需要支付被扣押的提成，还可能面临劳动监察部门的处罚，包括但不限于罚款、责令改正等。同时，公司还可能因违反劳动合同约定而需承担违约责任，赔偿员工因此遭受的损失。
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在不同情况下，员工可采取以下操作维护权益：若公司无故扣押提成，员工应首先与公司沟通协商，无果后可向劳动监察部门投诉，并提供相关证据；若协商及投诉均无果，员工可申请劳动仲裁，必要时可寻求法律援助或提起诉讼。同时，员工应保留好劳动合同、工资条、提成计算依据等证据，以备不时之需。
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从法律角度，员工应确保自己的提成不被非法扣押，可做到以下几点：一是签订劳动合同时，明确提成的计算方式、支付时间等条款；二是定期与公司核对提成数额，确保准确无误；三是留存好所有与提成相关的证据材料；四是如遇到提成被扣押的情况，及时与公司沟通，必要时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。